<div dir="ltr">Hi Mark,<br><br>In the base edition of my version the only filter that I see that works is the Contour filter. If you use the coproc.py script for co-processing script and replace FECxxAdaptor.cxx you should be able to get it to run properly. The results will be garbage but it will produce a pvtp file. <br>
<br>As for how to enable other filters in your build of Catalyst, that should be in section 4 of the user&#39;s guide or in <a href="http://www.paraview.org/Wiki/Generating_Catalyst_Source_Tree">http://www.paraview.org/Wiki/Generating_Catalyst_Source_Tree</a>. The cmake.sh file is just a simplified build script and doesn&#39;t do anything as far as enabling extra filters by itself.<br>
<br>Andy<br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Aug 15, 2013 at 10:08 AM, Vanmoer, Mark W <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mvanmoer@illinois.edu" target="_blank">mvanmoer@illinois.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">





<div link="blue" vlink="purple" lang="EN-US">
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">Hi Andy and Utkarsh,
<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">I’m not sure I can share the original code, so I tried the GitHub example Andy linked. I configured it to use the Catalyst build directory for ParaView_DIR.
 I still get the import errors, which I see I can ignore, but then also<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">Traceback (most recent call last):<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">  File &quot;&lt;string&gt;&quot;, line 2, in &lt;module&gt;<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">  File &quot;coproc.py&quot;, line 74, in DoCoProcessing<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">    coprocessor.UpdateProducers(datadescription)<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">  File &quot;/home/mvanmoer/builds/Catalyst/1.0.alpha-build/lib/site-packages/paraview/coprocessing.py&quot;, line 102, in UpdateProducers<u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">    self.CreatePipeline(datadescription)<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">  File &quot;coproc.py&quot;, line 30, in CreatePipeline<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">    self.Pipeline = _CreatePipeline(self, datadescription)<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">  File &quot;coproc.py&quot;, line 16, in _CreatePipeline<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">    class Pipeline:<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">  File &quot;coproc.py&quot;, line 19, in Pipeline<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">    Slice1 = Slice( guiName=&quot;Slice1&quot;, Crinkleslice=0, SliceOffsetValues=[0.0], Triangulatetheslice=1, SliceType=&quot;Plane&quot; )<u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">NameError: name &#39;Slice&#39; is not defined<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">Okay, is this because of what you’re talking about below, Utkarsh?  That the Catalyst build won’t necessarily have any particular filter in it, I’d have to
 specify what I need in the cmake.sh ahead of time?<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d">Mark<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p>
<div style="border:none;border-left:solid blue 1.5pt;padding:0in 0in 0in 4.0pt">
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #b5c4df 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;">From:</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:&quot;Tahoma&quot;,&quot;sans-serif&quot;"> Andy Bauer [mailto:<a href="mailto:andy.bauer@kitware.com" target="_blank">andy.bauer@kitware.com</a>]
<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, August 14, 2013 8:48 PM<br>
<b>To:</b> Utkarsh Ayachit<br>
<b>Cc:</b> Vanmoer, Mark W; <a href="mailto:paraview@paraview.org" target="_blank">paraview@paraview.org</a></span></p><div><div class="h5"><br>
<b>Subject:</b> Re: [Paraview] Building Catalyst<u></u><u></u></div></div><p></p>
</div>
</div><div><div class="h5">
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Utkarsh,<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt"><br>
Is it worth the trouble to get rid of these error messages in Catalyst? <u></u><u></u></p>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt">Also, the most up-to-date version of the user&#39;s guide is at
<a href="http://paraview.org/Wiki/images/4/48/CatalystUsersGuide.pdf" target="_blank">http://paraview.org/Wiki/images/4/48/CatalystUsersGuide.pdf</a>.<u></u><u></u></p>
</div>
<p class="MsoNormal">Andy<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:12.0pt"><u></u> <u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal">On Wed, Aug 14, 2013 at 9:33 PM, Utkarsh Ayachit &lt;<a href="mailto:utkarsh.ayachit@kitware.com" target="_blank">utkarsh.ayachit@kitware.com</a>&gt; wrote:<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">These are more of warning than errors. Catalyst can be thought of as a<br>
stripped down ParaView. Several modules/components are removed to keep<br>
the package small. There will be several &quot;editions&quot; of catalyst based<br>
on which components they contain. The idea is one decides which<br>
filters/components they are interested in using in-situ. Then we can<br>
create a custom edition containing only those filters and the<br>
components needed to get those filters working. This is to keep the<br>
library size small for production runs. For testing, ParaView itself<br>
includes the library against which the simulation adaptors can link.<br>
Thus one can create/test adaptors using a regular ParaView itself.<br>
That will have all the modules ParaView includes and hence one can<br>
experiment with the which filters to use and pick to come up with the<br>
short list of filters that can then be used to create a custom<br>
edition. Within the next week or so, we are will have a couple more<br>
editions available that will include some of the commonly used<br>
filters.<br>
<br>
Hope that clarifies things  a bit. FYI, there&#39;s a user&#39;s guide<br>
available too that may help clarify this:<br>
<a href="http://public.kitware.com/pipermail/paraview/2013-July/028795.html" target="_blank">http://public.kitware.com/pipermail/paraview/2013-July/028795.html</a><br>
<span style="color:#888888"><br>
<span>Utkarsh</span></span><u></u><u></u></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal"><br>
On Wed, Aug 14, 2013 at 6:18 PM, Vanmoer, Mark W &lt;<a href="mailto:mvanmoer@illinois.edu" target="_blank">mvanmoer@illinois.edu</a>&gt; wrote:<br>
&gt; Okay, I was able to compile and run a Fortran code using the FortranAdaptorAPI and I&#39;m getting some errors. (I had this code working with coprocessing and ParaView 3.14.1, so in theory it should still work).<br>

&gt;<br>
&gt; Error: Could not import vtkCommonComputationalGeometryPython<br>
&gt; Error: Could not import vtkCommonMiscPython<br>
&gt; Error: Could not import vtkCommonSystemPython<br>
&gt; Error: Could not import vtkRenderingCorePython<br>
&gt; Error: Could not import vtkFiltersCore<br>
&gt; Error: Cannot import vtkPVServerManagerDefaultPython<br>
&gt; Error: Cannot import vtkPVServerManagerRenderingPython<br>
&gt; Error: Cannot import vtkPVServerManagerApplicationPython<br>
&gt; Error: Could not create TimeKeeper<br>
&gt; Error: Could not create AnimationScene<br>
&gt;<br>
&gt; How do I get Catalyst to import these? Is it just a matter of setting $PYTHONPATH?<br>
&gt;<br>
&gt; Mark<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;&gt; -----Original Message-----<br>
&gt;&gt; From: Utkarsh Ayachit [mailto:<a href="mailto:utkarsh.ayachit@kitware.com" target="_blank">utkarsh.ayachit@kitware.com</a>]<br>
&gt;&gt; Sent: Wednesday, August 14, 2013 4:05 PM<br>
&gt;&gt; To: Vanmoer, Mark W<br>
&gt;&gt; Cc: <a href="mailto:paraview@paraview.org" target="_blank">paraview@paraview.org</a><br>
&gt;&gt; Subject: Re: [Paraview] Building Catalyst<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; Great! Feel free to ping the list if you run into issues or need assistance.<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; Utkarsh<br>
&gt;&gt;<br>
&gt;&gt; On Wed, Aug 14, 2013 at 4:21 PM, Vanmoer, Mark W<br>
&gt;&gt; &lt;<a href="mailto:mvanmoer@illinois.edu" target="_blank">mvanmoer@illinois.edu</a>&gt; wrote:<br>
&gt;&gt; &gt; Utkarsh,<br>
&gt;&gt; &gt; It did build this time, thank you.<br>
&gt;&gt; &gt; Mark<br>
&gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; -----Original Message-----<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; From: Vanmoer, Mark W<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; Sent: Wednesday, August 14, 2013 11:57 AM<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; To: &#39;Utkarsh Ayachit&#39;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; Cc: <a href="mailto:paraview@paraview.org" target="_blank">paraview@paraview.org</a><br>
&gt;&gt; &gt;&gt; Subject: RE: [Paraview] Building Catalyst<br>
&gt;&gt; &gt;&gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; Utkarsh,<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; I was just running ccmake, I read the wiki as cmake.sh was for<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; building Catalyst from the ParaView source tree. I&#39;ll try the<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; cmake.sh with the new tarball and report back.<br>
&gt;&gt; &gt;&gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; Mark<br>
&gt;&gt; &gt;&gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; -----Original Message-----<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; From: Utkarsh Ayachit [mailto:<a href="mailto:utkarsh.ayachit@kitware.com" target="_blank">utkarsh.ayachit@kitware.com</a>]<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Sent: Wednesday, August 14, 2013 11:52 AM<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; To: Vanmoer, Mark W<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Cc: <a href="mailto:paraview@paraview.org" target="_blank">paraview@paraview.org</a><br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Subject: Re: [Paraview] Building Catalyst<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Mark,<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; No, you wouldn&#39;t need to use any external VTK. I&#39;ve posted an<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; updated tarball. Feel free to give that a try. Also, how are you<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; starting the build? Using cmake.sh script included in the package?<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; Utkarsh<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; On Wed, Aug 14, 2013 at 11:38 AM, Vanmoer, Mark W<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &lt;<a href="mailto:mvanmoer@illinois.edu" target="_blank">mvanmoer@illinois.edu</a>&gt; wrote:<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt; Hi, I&#39;m trying to build Catalyst using the tarball from the<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt; Catalyst download page. I&#39;m getting the following error during<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt; the CMake configure<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt; step:<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt; CMake Error at VTK/CMake/vtkModuleTop.cmake:29 (message):<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;    No such module &quot;vtkChartsCore&quot; needed by<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &quot;vtkPVServerManagerApplication&quot;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;    Call Stack (most recent call first):<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;    VTK/CMake/vtkModuleTop.cmake:45 (vtk_module_check)<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;    VTK/CMake/vtkModuleTop.cmake:52 (vtk_module_check)<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;    VTK/CMakeLists.txt:348 (include)<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt; Is all of the necessary VTK with the Catalyst tarball, or do I<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt; need to have a separate VTK build?<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt; Thanks,<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt; Mark<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt;<br>
&gt;&gt; &gt;&gt; &gt; &gt; _______________________________________________<br>
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